سردردهای خوشهای و میگرن هر دو باعث درد میشوند، اما از نظر علائم، علت و درمان متفاوت هستند. به عنوان مثال، سردردهای خوشهای بارها در روز اتفاق میفتند در حالی که سردرد میگرنی یک اتفاق رایج روزمره نیست و اگر رخ دهد، فقط یک بار اتفاق میفتد. هم سردردهای میگرنی و هم خوشهای عمدتاً در یک طرف سر مشاهده میشوند.