روستای ” خفر ” در هفت کیلومتری شمال شرقی نطنز به فاصله ای کوتاه از جاده آسفالته مرکز شهر به بادرود و در کنار رودخانه ای خشک در دامنه تپه ای قرار گرفته است . روستای خفر در طول جغرافیایی 51 درجه و 58 دقیقه و33 درجه و 32 دقیقه عرض جغرافیایی قرار گرفته است . ارتفاع متوسط آن از سطح دریا 1410 متر می باشد .