او توانست با فولاد قهرمانی در جام حذفی و سوپرجام را به دست بیاورد، تیمش را به لیگ قهرمانان آسیا برساند و آنجا هم از مرحله گروهی بالا برود. مسابقات لیگ قهرمانان تا بهمن تعطیل است و شاید به نظر می‌رسید این شکاف طولانی و نیمکت خالی استقلال، نکونام را برای کوچ به پایتخت ترغیب کند. با این حال او با صدور بیانیه‌ای به‌طور رسمی اعلام کرد تصمیمش را برای رد پیشنهاد استقلال گرفته و آن را تغییر نخواهد داد. نکونام از رابطه دوستانه‌اش با مصطفی آجورلو، مدیرعامل استقلال سخن گفته و تاکید کرده جواب رد دادن به آدمی که زمانی در پاس تهران مدیرعامل خود او بود کار سختی است. با این حال او ترجیح داده در اهواز بماند.
اگرچه بسیاری از هواداران استقلال روی جذب مربی خارجی بزرگ تاکید دارند، اما اگر راهی جز استفاده از مربیان ایرانی نباشد، بیشتر آنها همین آقای نکونام را ترجیح می‌دادند. با این حال جواب منفی او، همه معادلات را تغییر داد. به نظر می‌رسد جواد با توجه به شرایط فعلی استقلال تصمیمی منطقی گرفته است. او می‌داند انتظارات از تیمی که فصل گذشته بدون شکست قهرمان شده بسیار بالاست و برای آنکه نوع فعالیتش «ناکامی» لقب نگیرد، باید خیلی بی‌نقص و ایده‌آل عمل کند. طبیعتا چنین شرایطی دشوار است و او ترجیح می‌دهد در زمانی دیگر، با فشاری کمتر سرمربی استقلال شود.
