هر لیوان آب هندوانه حاوی 250 میلی گرم سیترولین است؛ یک اسید آمینه که به آرژنین تبدیل می‌شود و به جلوگیری از تجمع بیش از حد چربی در بدن کمک می‌کند. طبق تحقیقات جدید مصرف آب هندوانه قبل از فعالیت بدنی شدید به کاهش ضربان قلب و درد عضلات کمک می‌کند و این به خاطر سیترولین موجود در آن است.