ساخت مسجد جامع خوانسار با حدود سه هزار مترمربع مساحت براساس سنگ نوشتهای که بر سر در آن نصب شده ، مربوط به سال 1101 هجری قمری است و به عنوان بزرگترین و قدیمی‌ترین مسجد شهرستان محسوب می شود که در جنوب شرقی و ورودی شهر از طرف اصفهان قرار گرفته است .
این مسجد در نقطه‌ای مرتفع واقع شده و با دیوارهای خشتی و آجری دارای گنبدی قوسی شکل و گچبری‌های بسیار نفیس و پنجره های زیبا و مشبک ارسی است .
مسجد دارای دو شبستان شرقی و غربی و محرابی تزئین شده به گچبری و خطوط کوفی و حوض سنگی یکپارچه است که آب آن از قناتی بنام گنگ در چند کیلومتری این مسجد و با لوله های گلی به آن منتقل میشده .
درب شمالی مسجد با منبت‌های بسیار نفیس دارای ارزش تاریخی و شبستان زمستان نشین از دیگر ویژگی های خاص و زیبای این مسجد است .
این اثر ماندگار ، سال 1354 در فهرست آثار ملی کشور به شماره 1190 به ثبت رسیده و برای بازسازی و مرمت آن تاکنون 7 میلیارد ریال هزینه شده است .
