به گزارش ایسنا، این موزه ابتدا در سالنی به مساحت 200 متر گشایش یافت. در طول کارافراد مختلفی مجموعه های خود را به آن هدیه دادند. اوایل، هدف اتاق کاملا آموزشی بود اما از سال 1866 هفته ای یک بار بازدید کنندگان می توانستند بطور آزاد از آن دیدن کنند. علاوه بر این، افراد متخصص، ضمن بازدیدها مقالات خود را ارایه می‌کردند.
تقریباً تمامی این مجموعه در آتش‌سوزی سال 1812 (حمله ناپلئون به مسکو) از بین رفت. در دهه 20 قرن 19 این محل مجدداً ساخته شد. در 1822 موزه دارای قریب یک هزار نمونه جانوران مهره داران و 20 هزار نمونه بی مهرگان بود. از 1937 تا 1858 کارشناسان این موزه به تحقیقات جانوران روسیه و جمع آوری اطلاعات و نمونه های مختلف توجه زیادی نشان دادند که باعث شد در اواخر دهه 50 در موزه بیش از 65 هزار نمونه جمع آوری شود. اما در این دوره تنها دانشجویان و استاتید دانشگاه حق داشتند از آن بازدید کنند.
پروفسور بوگدانف که رئیس موزه از 1863 تا 1896 بود نقش مهمی در پیشرفت موزه جانورشناسی داشت او نمونه هایی را هدیه کرد و باعث افزایش کمی و کیفی موزه شد.
در زمان ریاست باگدانف موزه به بخش های علمی، آموزشی و نمایشی تقسیم شد و در چارچوب موزه، کرسی جانورشناسی و آزمایشگاه تحقیقاتی تشکیل گردید. در سال 1866 موزه برای بازدید عموم آزاد شد.
طی سالهای 1898 تا 1901 ساختمان مخصوص موزه جانورشناسی بنا گردید که هنوز هم از آنها استفاده می‌شود. این ساختمان سه طبقه, قریب 6 هزار متر مساحت دارد که از جمله می توان به سالن های نمایش 2 هزار متری، سالن 2300 متری نگهداری نمونه ها و بالاخره اتاق های کار و پژوهش اشاره کرد. علاوه بر این، سالنی برای ارایه مقاله و کتابخانه در این موزه وجود دارد.
در دهه 1920 در این موزه، پژوهشگاه علمی-تحقیقاتی جانورشناسی گشایش یافت و از1930 یک بخش دانشکده زیست شناسی دانشگاه دولتی مسکو که خود موزه شعبه این دانشکده بود درآن آغاز به کار کرد. در سال 1931 موزه جانورشناسی زیر نظر ریاست بخش موزه ها در وزارت آموزش قرار گرفت و نام آن به موزه مرکزی دولتی جانورشناسی تغییر یافت و موزه آناتومی نیز به آن پیوست.
در ژوییه 1941 و ورود جنگ جهانی دوم به روسیه، تمام سالن های موزه بسته شد، مجموعه علمی به عشق آباد منقل گردیدند اما چندی بعد مجموعه برگردانده و فعالیت را مجددا آغاز کرد.
در دهه‌های 70 و80 موزه بازسازی گردید، مساحت سالن های نگهداری افزایش یافت و سالن های نمایش جدید جای سالن های قدیمی را گرفت.
در حال حاضر مجموعه موزه بیش از 5/4 میلیون نمونه را شامل می شود که هر سال تقریباً 30-25 هزار به آن اضافه می گردد. بزرگ ترین مجموعه این موزه به حشرات تعلق دارد که از حدود 3 میلیون نمونه عبارت است. مجموعه پستاندارن 200هزار و پرندگان 140 هزار نمونه را شامل می شوند. از نظر کمیت مجموعه این موزه یکی از 10 موزه جانورشناسی بزرگ جهان به حساب می آید و در روسیه مقام دوم را به خود اختصاص داده است.
موزه با تقریباً یکصدوپنجاه موزه خارجی تاریخ طبیعی مبادله مجموعه و اطلاعات می کند. سالی تقریباً سیصد جانورشناس از انستیتوهای دیگر از جمله موسسات تحقیقات خارجی با این موزه همکاری و تبادل اطلاعات دارند و در تحقیقات خود از اطلاعات موجود در این موزه بهره می برند.
کتابخانه موزه ، شامل 300 هزار جلد کتاب در مینه تاریخ طبیعی و جانورشناسی است.
