به گزارش "ورزش سه"، زمانی که گواردیولا در سال 2008 هدایت بارسلونا را برعهده گرفت، قصد دارد مانند رونالدینیو و دکو، ستاره کامرونی تیمش را هم بفروشد اما در نهایت اتوئو یک فصل دیگر در نوکمپ ماند و کمک کرد تا این تیم به یک سه گانه تاریخی برسد. اما رابطه او با گواردیولا هرگز خوب پیش نرفت و او اکنون مربی سابقش را مورد انتقاد قرار داد.
او به خبرنگاران گفت:" پپ همه زندگی اش را در بارسلونا گذراند اما در سال هایی که من در بارسلونا بودم، او بازیکنان تیم را درک نمی کرد. او نمی توانست خودش را جای بازیکنان تیم بگذارد."
در آن زمان گفته می شد که دلیل اختلاف اتوئو و گواردیولا، ترجیح مسی به این گلزن کامرونی توسط مربی آبی و اناری ها بود؛ چیزی که اتوئو هم آن را تایید می کند:" به گواردیولا گفتم او از من عذرخواهی خواهی کرد زیرا این من هستم که پیروزی های بارسا را رقم می زنم، نه مسی. شرایط در آن زمان اینطور بود. مسی بعد از من به بارسا آمد. می توانید از ژاوی، اینیستا و بقیه بپرسید. آن دوره، دوره من بود. این من بودم که پیروزی های بارسا را رقم زدم و پپ از من عذرخواهی کرد."
اتوئو در نهایت در تابستان 2009 بارسا را به مقصد اینتر ترک کرد؛ در حالی که فصل پیش از آن در لالیگا 30 گل به ثمر رساند و اولین گل بارسا در فینال چمپیونزلیگ مقابل منچستریونایتد را نیز او زد. به همین دلیل از اینکه متوجه شد گواردیولا قصد فروش او را دارد، بسیار شوکه شد:" وکیلم به من گفت که باشگاه من را برای فروش در بازار گذاشت. من گفتم واقعا؟ او گفت بله، به درخواست گواردیولا.
اکنون واضح است که آن انتقال و فرصتی که گواردیولا به من داد، در تاریخ ثبت شد زیرا به من اجازه داد تا با اینتر، در تاریخ فوتبال نقش بیشتری داشته باشم. او به اینتر اجازه داد تا بهترین انتقال تاریخ فوتبال را انجام بدهد."
اتوئو در فصل 10-2009 با شکست بارسلونا در نیمه نهایی، توانست با اینتر هم قهرمان چمپیونزلیگ شود.