به گزارش مشرق، هشتم تیر سال 1395 فرمانده کل قوا حضرت امام خامنه‌ای (مد ظله‌العالی) در حکمی سردار سرلشکر پاسدار محمدحسین باقری را به ریاست ستاد کل نیروهای مسلح منصوب کردند تا پس از 27 سال ریاست سرلشکر حسن فیروزآبادی، وی به عنوان رئیس جدید ستاد کل نیروها مسلح ایفای نقش کند.
در حکم انتصاب وی آمده بود:
«بسم الله الرحمن الرحیم
سردار سرلشکر پاسدار محمدحسین باقری
با توجه به انتقال سردار سرلشکر بسیجی دکتر سیّد حسن فیروزآبادی به جایگاه مشاورت عالی فرماندهی کلّ نیروهای مسلح، و نظر به خدمات شایسته و تجارب ارزنده جناب‌عالی در دوران دفاع مقدس و پس از آن به‌ویژه در مسئولیت‌های ستاد کل و قرارگاه خاتم‌الانبیاء (ص)، شما را به ریاست ستاد کل نیروهای مسلح منصوب می‌کنم.
با تمسک و امید به عنایات الهی، ارتقاء توانمندی‌ها و آمادگی‌های دفاعی امنیتی نیروهای مسلح و بسیج مردمی و امکان پاسخگویی به‌موقع و مؤثر به هر سطح و نوع از تهدیدات متوجّه به نظام جمهوری اسلامی ایران با عمل انقلابی مورد انتظار است.
از تلاش‌های مخلصانه و مدبّرانه سردار سرلشکر بسیجی دکتر فیروزآبادی از ابتدا تا کنون در این مسئولیت مهم قدردانی و تشکر می‌کنم.
دوام توفیقات همگان را از خداوند متعال مسئلت می‌کنم.
سیّد علی خامنه‌ای»
محمد باقری از فرماندهان دوران دفاع مقدس و برادر کوچکتر فرمانده شهید «حسن باقری» مسوول اطلاعات عملیات سپاه در هشت سال دفاع مقدس است که در سال 1339 در تهران به دنیا آمد. در سال 1359 پس از تعطیلی دانشگاه به سبب انقلاب فرهنگی به سپاه پاسداران انقلاب اسلامی پیوست که همزمان با درگیری‌های ضد انقلاب در کردستان شد. یک ماه از جنگ گذشته بود که به جبهه رفت و مسوولیت‌های اطلاعاتی عملیاتی را در کنار برادر خود برعهده گرفت و در عملیات‌های مختلف حضور فعال داشت.
از سال 1362 تا پایان دوران جنگ تحمیلی بعنوان مسئول اطلاعات عملیات نیروی زمینی سپاه پاسداران انقلاب اسلامی و قرارگاه کربلا، قرارگاه خاتم‌الانبیا (ص) حضور داشته است.
او که دارای سابقه جانبازی در دفاع مقدس نیز هست پس از جنگ در مسؤلیت‌های مختلف بعنوان رئیس اداره اطلاعات و سپس معاون اطلاعات و عملیات ستاد کل همچنین رئیس ارکان و امور مشترک نیروهای مسلح تاکنون ایفای مسئولیت و به موازات آن از سال 1386 بعنوان معاون هماهنگ‌کننده قرارگاه مرکزی خاتم‌الانبیاء (ص) خدمت کرده است. او دارای مدرک دکترای جغرافیای سیاسی و ژئوپلیتیک از دانشگاه تربیت مدرس و عضو هیات علمی دانشگاه دفاع ملی با مرتبه استادتمامی است و به تدریس در دانشگاه عالی دفاع ملی و دانشگاه تربیت مدرس نیز اشتغال دارد.
باقری به علت انجام فعالیت‌های شایسته در دوران دفاع مقدس مفتخر به دریافت سه نشان فتح و برای فعالیت‌های پس از دفاع مقدس یک نشان نصر از دست مبارک فرماندهی معظم کل قوا شد و همزمان با سرلشکر ایزدی درجه سرلشکری را از رهبر معظم انقلاب اسلامی دریافت کرد و پس از دریافت این درجه بود که به ریاست ستاد کل نیروهای مسلح منصوب شد.
همچنین وی دارای تالیفاتی در زمینه ژئوپلیتیک قفقاز، منطقه غرب آسیا، حقوق بین‌الملل دریایی جمهوری اسلامی در خلیج فارس و تنگه هرمز بوده و عضو قطب علمی جغرافیای سیاسی کشور و هیات موسس انجمن ژئوپلیتیک ایران نیز هست.