امام صادق (ع) از نظر علم و فضل سرآمد روزگار خود به شمار می آمد. امام مالک بن انس درباره آن حضرت گفته است: در فضیلت و دانش و عبادت و پارسایی هیچ دیده ای چون جعفر بن محمد را ندیده و هیچ گوشی توصیف آن را نشنیده و بر هیچ قلبی خطور نکرده است. او بسیار سخی، خوش مشرب و پرفایده بود.
حسن بن زیاد گفت: از ابو حنیفه درباره فقیه ترین کسی که دیده پرسش شده؟گفت: فقیه ترین کسی که دیده ام جعفر بن محمد بوده است.
ابن ابی لیلی گوید: من هیچ سخن یا تصمیمی را کنار نگزارده ام مگر به قول یک تن و او جعفر بن محمد است.
هیچ کس جز امیر مومنان علی بن ابی طالب (ع) و فرزندش جعفر بن محمد فریاد نکرد که سلونی قبل ان تفقدونی. جنابذی در کتاب معالم العترة الطاهرة از صالح بن اسود نقل کرده است که گفت: شنیدم جعفر بن محمد می گوید: پیش از آن که مرا از دست دهید از من پرسش کنید. زیرا آنچه من برای شما می گویم کسی نمی تواند مانند آن را بگوید.
امام صادق (ع) می فرمود: حدیث من حدیث پدرم و حدیث پدرم حدیث جدم و حدیث جدم حدیث علی بن ابی طالب و حدیث علی حدیث رسول خداست: از آن حضرت به اندازه ای از علوم ارزشمند روایت شده که موجب شگفتی عقل می شود. دانشمندان آنقدر که از امام صادق (ع) روایت نقل کرده اند، از دیگر اهل بیت روایت نیاورده اند. و هیچ یک از صاحبان آثار و راویان اخبار بدان اندازه که از محضر امام صادق (ع) کسب فیض کرده اند، از دیگران بهره نبرده اند.