به گزارش «ایسنا»، وزارت امور خارجه جمهوری اسلامی ایران در پی شهادت «اسماعیل هنیه» رئیس دفتر سیاسی حماس در تهران در بیانیه‌ای اعلام کرد که «بامداد چهارشنبه مورخ 10 مرداد 1403، مجاهد خستگی‌ناپذیر شیخ اسماعیل هنیه رئیس دفتر سیاسی حماس و یار دیرین شهید قدس، سردار سپهبد حاج قاسم سلیمانی و از رهبران پرافتخار و شجاع مقاومت فلسطین که برای شرکت در مراسم تحلیف رئیس‌جمهور منتخب جمهوری اسلامی ایران، میهمان دولت و مردم ایران بود، مورد هدف یک اقدام تروریستی از سوی دشمن اشغالگر اسرائیل قرار گرفته و به شهادت رسید.»
وزارت خارجه ایران «ترور شهید اسماعیل هنیه به عنوان یکی از رهبران منتخب مردم فلسطین و یکی از طلایه‌داران مبارزه مشروع ملت فلسطین برای احقاق حق تعیین سرنوشت» را «شاهد دیگری بر ماهیت تروریستی و نشانه‌‌ای از خوی تجاوزگری و قانون‌‌شکنی مافیای جنایتکار حاکم بر سرزمین اشغال شده فلسطین» توصیف کرده است. تهران تاکید کرد: این اقدام تروریستی نه تنها نقض فاحش اصول و قواعد حقوق بین‌الملل و منشور ملل متحد است، بلکه تهدیدی جدی علیه صلح و امنیت منطقه‌‌ای و بین‌المللی است. در ادامه این بیانیه آمده است: این اقدام رژیم جنایتکار اسرائیل، در تداوم ترور رهبران مقاومت فلسطین در کشورهای دیگر در چند دهه گذشته رخ داده است، اما اقدام متجاوزانه و تروریستی جدید این رژیم در ترور شهید هنیه بخشی از برنامه نسل‌‌کُشی فلسطینیان بهویژه در 10 ماه اخیر و در جهت افزایش ناامنی در منطقه غرب آسیاست.
وزارت امور خارجه جمهوری اسلامی ایران همچنین اعلام کرد «مسوولیت دولت آمریکا به عنوان حامی و همدست رژیم صهیونیستی در استمرار اشغالگری و نسل‌‌کُشی فلسطینیان، در ارتکاب این اقدام شنیع تروریستی را مورد تاکید قرار می‌دهد.»در ادامه این بیانیه تصریح شده است: جمهوری اسلامی ایران اقدام متجاوزانه رژیم صهیونیستی در ترور مجاهد خستگی‌ناپذیر شیخ اسماعیل هنیه را شدیدا محکوم می‌کند و با تاکید بر حق ذاتی خود در پاسخ مناسب نسبت به این اقدام متجاوزانه علیه حاکمیت و تمامیت سرزمینی خود، انتظار دارد که کشورها و سازمان‌های بین‌المللی در راستای حمایت از حق تعیین سرنوشت ملت فلسطین و مقاومت مشروع آنان در برابر اشغالگری، رژیم اسرائیل را به طور جدی و موثر مورد مؤاخذه قرار داده و تدابیر سیاسی، حقوقی و تنبیهی لازم را در قبال این رژیم یاغی اتخاذ نمایند.
وزارت امور خارجه جمهوری اسلامی ایران در پایان «شهادت این مجاهد بزرگ و همراه ایشان را به محضر مقام معظم رهبری حضرت آیت‌الله العظمی امام خامنه‌‌ای، امت اسلامی و ملت غیور فلسطین، جنبش مقاومت اسلامی فلسطین (حماس)، خانواده آن شهید عزیز، گروه‌‌های مقاومت فلسطینی و همه اجزای محور مقاومت، کلیه دولت‌‌ها و ملت‌‌های حامی آرمان فلسطین و آزادی‌خواهان جهان تبریک و تسلیت» گفت.
«علی باقری» سرپرست وزارت خارجه ایران نیز در پیامی در صفحه شخصی خود در فضای مجازی نوشت: ترور بزدلانه رهبر پرافتخار مقاومت فلسطین، اسماعیل هنیه، یار دیرین شهید قدس، سپهبد حاج قاسم سلیمانی، مردم و مقاومت قهرمان فلسطین، جهان اسلام و همه انسان‌‌های آزادی‌‌خواه را در مسیر پرعزت جهاد علیه اشغالگری و نسل‌کشی، مصمم‌‌تر خواهد ساخت.وی ادامه داد: شهید هنیه، به عنوان یکی از رهبران ملت فلسطین و طلایه‌‌دار مبارزه مشروع برای احقاق حق تعیین سرنوشت مردم فلسطین، مهمان رسمی مردم و دولت ایران در مراسم تحلیف رئیس‌جمهور منتخب ایرانیان بود و اقدام تروریستی مافیای تروریستی حاکم بر سرزمین اشغال شده فلسطین، نقض فاحش اصول و قواعد حقوق بین‌الملل، منشور ملل متحد و بی‌‌حرمتی به امنیت ملی و تمامیت سرزمینی جمهوری اسلامی ایران است. باقری تاکید کرد: جمهوری اسلامی ایران این اقدام مجرمانه نفرت‌‌انگیز را به شدیدترین وجه ممکن محکوم کرده و بر حق خود برای پاسخ مناسب تاکید می‌‌نماید.
همزمان نمایندگی ایران در سازمان ملل در نیویورک در پی ترور اسماعیل هنیه، رئیس دفتر سیاسی حماس در تهران، اعلام کرد: پاسخ ترور، عملیات ویژه است؛ اما سخت‌‌تر و پشیمان‌‌کننده. همچنین عضو هیات ایران در نشست کمیته مقدماتی کنفرانس بازنگری معاهده منع گسترش تسلیحات هسته‌‌ای گفت که ترور شهید هنیه، نقض فاحش اصول اولیه حقوق بین‌الملل و منشور سازمان ملل است. رضا غائبی، دستیار مدیرکل صلح و امنیت بین‌المللی وزارت امور خارجه در نشست کمیته مقدماتی دوم کنفرانس بازنگری معاهده منع گسترش تسلیحات هسته‌‌ای در ژنو، با محکومیت شدید ترور اسماعیل هنیه توسط رژیم تروریست و آپارتاید صهیونیستی اعلام کرد بیش از هفت دهه است که سیاست‌‌ها و اقدامات بی‌‌رحمانه و وحشیانه رژیم اسرائیل به طور مداوم و فاحش قواعد و اصول حقوق بین‌الملل، از جمله حقوق بین‌الملل بشردوستانه و قواعد بین‌المللی حقوق بشر را نقض کرده است.
چنین جنایات فجیع و دهشتناکی بهویژه جنایات جنگی، جنایات علیه بشریت، نسل‌کشی، پاکسازی قومی، عملیات تروریستی هدفمند و جابه‌جایی اجباری توسط رژیم آپارتاید نظامی اشغالگر، نشانگر ذات سرکش و قانون شکن این رژیم است.غائبی افزود: ناکامی جامعه بین‌المللی در وادار ساختن رژیم اسرائیل به رعایت قوانین بین‌المللی، پایان دادن به اشغال غیرقانونی و وحشیگری‌ها علیه مردم فلسطین، چراغ سبزی برای این رژیم برای ادامه ارتکاب جنایات خود از جمله نقض حاکمیت کشورها و ترور شخصیت‌‌های سیاسی برجسته فلسطینی است. سفیر جمهوری اسلامی ایران در لبنان نیز با بیان اینکه ایران اجازه نمی‌‌دهد منطقه تحت اداره آمریکا و اسرائیل قرار بگیرد گفت: همان‌طور که از مراسم تحلیف رئیس‌جمهور دیدید مشخص بود که سیاست ایران در قبال مقاومت تغییری نکرده در حوزه سیاست داخلی هم رئیس‌جمهور مواضع خاص خودشان را دارند که آن هم منطبق بر قانون اساسی است.