یکی از بحث های مربوط به اختیارات فقیه جامع الشرایط به عنوان نایب عام حضرت ولیعصرعج، «جهاد ابتدایی» است. فقها در این مسأله دو گروه هستند؛
عده ای معتقدند جهاد ابتدایی، تنها در اختیار پیامبر و امامان معصوم علیهم السلام است و گروه دیگر بر این عقیده اند که فقیه جامع الشرایطی که در عصر غیبت زمام امور مسلمین را در دست دارد، همه ی اختیارات حکومتی پیامبر و امامان معصوم را بدون هیچ استثنائی داراست و بدین ترتیب جهاد ابتدائی را هم یکی از اختیارات ولی فقیه می دانند.
حضرت امام در زمان تألیف کتاب ارزشمند «تحریرالوسیله»، در زمره ی گروه اول بوده و همین نظر را در تحریرالوسیله آورده است، اما با افزایش تحقیقات و پژوهش های فقهی، به این نتیجه رسید که «در تمامی مسائل مربوط به حکومت، همه ی آنچه که از اختیارات و وظایف پیامبر«ص» و امامان پس از او محسوب می شود، در مورد فقهای عادل نیز معتبر است.»[1]
در پی اعلام این نظر، تعدادی از فضلای نجف اشرف در نامه ای که در صفحه ی بعد به چاپ رسیده، از امام اجازه خواستند که عبارت تحریرالوسیله را در چاپ های بعدی، مطابق نظر اخیر اصلاح نمایند.
امام ضمن تأیید دیدگاه جدید با «تغییر» عبارت تحریرالوسیله به منظور حفظ اعتبار آن، مخالفت نمود اما اجازه داد قسمتی را که صریحا مخالف این نظر است، «حذف» شود:
بسمه تعالی
گر[چه] الان نظرم مساعد با همین امر است که مرقوم شده است، لکن اکتفا کنید به حذف آن جمله ولی عبارت تحریر را تغییر ندهید. فقط حذف آن جمله را بکنید.
[1]. امام خمینی، شئون و اختیارات ولی فقیه، وزارت فرهنگ و ارشاد اسلامی، تهران: 1365. ص33.
