مسجد امامزاده محمد (بسطام) این بنا بین امامزاده محمد و مسجد سلجوقی، در مجموعه تاریخی بایزید بسطامی واقع است . از ظواهر امر پیداست که ابتدا به صورت حیاط کوچکی بوده؛ ولی در زمان قاجاریه آن را پوشانده اند . طبق کتیبه موجود، این بنا در سال 1242 ه- . ق زمان فتحعلی شاه قاجار- تعمیر شده است . در ضلع جنوبی مسجد، سه در کنده کاری شده دیده می شود که رابط بین این قسمت و مسجد سلجوقی است . بر گردا گرد دیوار مسجد، آیاتی از قرآن گچبری شده است . ضلع غربی مسجد به واسطه یک محوطه مربع کوچک، به مسجد زنانه ایلخانی مربوط می شود . این مسجد، دو راه به بیرون دارد ؛ یکی به کوچه پشت مسجد و دیگری به رواق حرم امامزاده محمد . بر روی در طرف کوچه، منبت کاری نسبتا زیبایی به چشم می خورد؛ ولی به ظرافت درسه لنگه مسجد نیست .
