مطالعه درباره معماری مسجد میغان نشان دهنده تأثیرات اقلیم روستایی بر این بناست. در همین خصوص می توان از وسعت محدود این مسجد یاد کرد که با نگرش به جمعیت آن زمان روستا طراحی شده است.
مسجد میغان بطور کلی در یک مساحت محدود و کوچک ساخته شده است و اجزاء معماری آن عبارتست از صحن، شبستان گنبددار و شبستان ستوندار و گنبد خانه و با وجود این اثری ممتاز در یک روستای دور افتاده به شمار می آید. در صحن مسجد قناتی جاری است که از زیر این قسمت عبور کرده و بطرف دیگر بنا می رود که در آن قسمت نیز این آبها توسط آبگیری در پشت مسجد جمع شده و به مصارف مختلف بخصوص کشاورزی می رسد.
یک ورودی در صحن مسجد قرار دارد که به داخل شبستان گنبد دار مرتبط می شود و محوطه ای مستطیل شکل را شامل می گردد که سقف آن گنبدی است و تعداد 3 گنبد در این فضا جای گرفته اند که زیر این گنبدها تزئینات رسمی بندی زیبائی مشاهده می گردد. از زیباترین قسمتهای این مسجد که دارای فره معماری خاصی است شبستان ستوندار آن می باشد که این بخش محوطه ای است که ستونهای چهار ضلعی پایه سقف آن را تشکیل داده است.
