آستان باشکوه امامزاده سیدجعفرمحمد(علیه السلام) دردروازه قرآن یزد ودرضلع جنوبی جاده یزد ـ تهران (بلوار جمهوری اسلامی) واقع شده و از بقاع متبرکه و پررونق شهرستان یزد به شمارمی آید. بنای اصلی آن که ازخشت وگل و با نمای آجری متعلق به دوره قاجاریه بوده درسال 1348 هجری شمسی تخریب و به جای آن بنای بسیار با ابهتی درابعاد 14×14 متر ساخته شده است. و با اضافه نمودن مساحت دو ایوان سمت شرقی و شمالی حرم مساحتی درحد 240 مترمربع دارد فضای باز زیرگنبد با ارتفاع 5/24 ازسطح زمین شکوه وعظمتی به این مکان داده است. بدنه حرم با سنگ مرمر یزد تزیین شده که در نوع خودکم نظیراست و مابین سنگ بدنه و آینه کاری اشعاری روی سنگ حک شده که باعث زیبایی مضاعف این بنا شده است سپس آینه کاری شروع می شود که بقیه نمای درونی حرم را تزیین نموده. ضریح در ابعاد 4×3 متر واز قطعات طلا ونقره ساخته شده است و اطراف آن چهل تاج طلا دارد که روی آنها اسماءالله برزمینه مینا نقش بسته. دردانشنامه مشاهیریزد نیزنوشته شده: «امامزاده سیدجعفرمحمد فرزند ابوالحسن علی ونوه امامزاده جعفر معروف به سیدجعفردر اواخرسده چهارم به دنیاآمد. نسبش با شش واسطه به امام جعفرصادق (علیه السلام) می رسد. برخی وی را از نوادگان امام سجاد (علیه السلام) درسده پنجم هجری قمری درگذشت. علامه نسابه ابوالحسن علی بن القاسم بن زید بیهقی درتقریر نسب وی بعد از اشاره به نسب شریف امامزاده جعفریزد می نویسد: «و برای علی بن محمد أبی جعفر (امامزاده جعفر یزد) بن علی بن عبیدالله بن احمد الشعرانی بن علی العریضی بن امام جعفر صادق (علیه السلام) سه فرزند به اسامی ذیل است: ابوالحسن زید، ابوجعفرمحمد و ابوطالب طاهر» السَّلامُ عَلَیکَ اَیُّهَا السَّیِّدُ الزَّکِیُّ، اَلطّاهِرُ الوَلِیُّ، وَالدّاعِی الحَفِیُّ؛ اَشهَدُ اَنَّکَ قُلتَ حَقّاً، حَقّاً، وَنَطَقتَ حَقّاً وَصِدقاً، وَدَعوتَ اِلی مَولایَ وَمَولاکَ، عَلانِیَةً وَسِرًّا، فازَ مُتَّبِعُکَ، وَنَجا مُصَدِّقُکَ، وَخابَ وَخَسِرَ مُکَذِّبُکَ، وَالمُتَخَلِّفُ عَنکَ، اَشهَد لی بِهذهِ الشَّهادَةِ، لِاَکونَ مَنَ الفائِزینَ بِمَعرِفَتِکَ وَطاعَتِکَ، وَتَصدیقِکَ وَاتِّباعَکَ، وَالسَّلامُ عَلَیکَ یا سَیِّدی وَابنَ سَیِّدی. اَنتَ بابُ اللهِ المُؤتی مَنهُ، وَالمَأخوذُ عَنهُ، اَتَیتُکَ زائِراً، وَحاجاتی لَکَ مُستَودِعةً، وَها اَنَا ذا اَستَودِعُکَ دینی وَاَمانَتی، وَخَواتیمَ عَمَلی، وَجَوامِعَ اَمَلی اِلی مُنتَهی اَجَلی، وَالسَّلامُ عَلَیکَ وَ رَحمَةُ اللهِ وَبَرَکاتُه. *** سلام بر تو ای آقای پاک و پاکیزه و سرور من و ای دعوت کننده (به حق) به مهربانی، گواهی دهم که تو حق گفتی و به حق و راستی سخن کردی و (مردم را) آشکارا و نهان بسوی مولای من و مولای خودت دعوت فرمودی رستگار شد پیرو تو و نجات یافت تصدیق کننده ات و نومید و زیانکار شد تکذیب کننده ات و آنکس که با تو مخالفت کرد گواه باش برای من این گواهی را تا من بوسیله معرفت و اطاعت تو و تصدیق و پیروی کردنت از زمره رستگاران باشم و سلام بر تو ای آقای من و ای فرزند آقای من توئی درگاه خدا که از آن درآیند و (معالم دین را) از آن بگیرند آمده ام به درگاهت برای زیارت و حاجتهای خود را به تو سپرده ام و من اکنون به تو می سپارم دینم و امانتم و سرانجام کارهایم و همه آرزوهایم را تا پایان عمرم و بر تو باد سلام و رحمت خدا و برکاتش.
منبع: صداو سیمای مرکز یزد